O desapacho RT/C-151/2004 aprovou o novo plano de estudos, resultante da reestruturação de MCC. Este despacho establece também normas de transição para este novo plano de estudos, enquadradas no despacho RT-49/87, que establece as normas de transição entre planos de estudo para os cursos de licenciatura da Universidade do Minho.
A transição para o novo plano de estudos é feita de forma gradual de acordo com a seguinte tabela:
| Ano curricular | |||||
| Ano lectivo | 1º | 2º | 3º | 4º | 5º |
| 2004/2005 | Plano Novo | Plano Antigo | Plano Antigo | Plano Antigo | Plano Antigo |
| 2005/2006 | Plano Novo | Plano Novo | Plano Antigo | Plano Antigo | Plano Antigo |
| 2006/2007 | Plano Novo | Plano Novo | Plano Novo | Plano Antigo | Plano Antigo |
| 2007/2008 | Plano Novo | Plano Novo | Plano Novo | Plano Novo | Plano Antigo |
| >=2008/2009 | Plano Novo | Plano Novo | Plano Novo | Plano Novo | Plano Novo |
Deste modo, serão necessariamente inseridos no novo plano de estudos os alunos que em 2004/05 se inscrevem no 1º Ano de MCC, os alunos que em 2005/06 se increvem no 2º Ano de MCC, e assim sucessivamente.
Na transição para o novo plano de estudos aplica-se a Tabela de Equivalências entre disciplinas que se segue:
Tabela de Equivalências
| Disciplina do Plano Antigo | Disciplina correspondente no Plano Novo |
| Álgebra Linear | Álgebra Linear |
| Cálculo | Cálculo |
| Análise | Análise |
| Matemática Discreta I | Tópicos de Matemática |
| Matemática Discreta II | Lógica |
| Paradigmas da Programação I | Programação Funcional |
| Paradigmas da Programação II | Programação Imperativa |
| Matemática Computacional | Matemática Computacional |
| Elem. Lógicos da Programação II | Semântica da Programação |
| Paradigmas da Programação IV | Programação Orientada aos Objectos |
| Métodos de Programação I | Cálculo de Programas |
| Métodos de Programação II | Algoritmos e Complexidade |
| Arquitecturas de Computadores | Arquitectura de Computadores |
| Álgebra | Estruturas Algébricas |
| Análise Numérica I | Análise Numérica |
| Probabilidades e Estatística | Teoria das Probabilidades |
| Processamento de Linguagens I | Proc. de Ling. e Compiladores |
| Autómatos e Máquinas de Turing | Teoria das Linguagens |
| Sistemas Operativos I | Sistemas Operativos |
| Métodos Formais da Programação I | Métodos Formais da Programação |
| Bases de Dados | Bases de Dados |
| Comunicações por Computador I | Comunicações por Computador |
| Estágio | Estágio |
(1) Para efeitos de transição para o novo plano de estudos consideram-se com aproveitamento na discipina de Lógica Computacional os alunos com aproveitamento nas disciplinas de Elementos Lógicos de Programação I e de Paradigmas de Programação III.
(2) Para efeitos de transição para o novo plano de estudos consideram-se com aproveitamento na discipina de Processos e Concorrência os alunos com aproveitamento nas disciplinas de Elementos Lógicos de Programação III e de Métodos de Programação IV.
Aos alunos inseridos no plano de estudos antigo, com disciplinas em atraso que deixaram de ser leccionadas e que não constam do novo plano de estudos, são dadas as seguintes alternativas:
Tabela de Substituição
| Plano Antigo | Plano Novo |
| Álgebra Linear e Geometria Analítica | Álgebra Linear e Geometria Analítica (LESI) |
| Tópicos de Análise | Matemática Discreta |
| Elementos Lógicos da Programação I | Opção 1.1 |
| Paradigmas da Programação III | Programação Concorrente |
| Análise Numérica II | Geometria |
| Métodos de Programação III | Modelação Matemática (LM) |
| Elementos Lógicos da Programação III | Opção 1.2 |
| Métodos da Programação IV | Opção 1.3 |
| Investigação Operacional I | Equações Diferenciais (LM) |
| Estatística Aplicada | Sistemas Dinâmicos (LM) |
| Métodos Formais de Programação II | Teoria das Categorias |
| Representação do Conhecimento I | Opção 1.4 |
| Opção I | Teoria dos Números Computacional |
| Opção II | Computação Gráfica |
| Opção III | Opção 2.1 |
| Opção IV | Opção 2.2 |
| Opção V | Opção 2.3 |
| Opção VI | Opção 2.4 |
LESI - Licenciatura em Engenharia de Sistemas e Informática
LM - Licenciatura em Matemática